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BLAST 序列比对
BLAST
序列比对
Basic Local Alignment Search Tool · CGD × SequenceServer
blastn
核酸 → 核酸库
blastp
蛋白 → 蛋白库
blastx
核酸 → 蛋白库
tblastn
蛋白 → 核酸库
tblastx
核酸(翻译) → 核酸库
输入查询序列
支持 FASTA 格式或裸序列
粘贴
DNA/RNA
序列(blastn)
载入示例
粘贴
清空
等待输入序列…
示例:
ALS 基因片段
PEPC 蛋白序列
ITS 核糖体序列
CYP450 基因
高级参数设置
+
E-value 阈值
?
1e-3
1e-5
1e-10
1e-20
1e-50
1e-100
最大命中数
?
10
50
100
250
500
打分矩阵
BLOSUM62
BLOSUM80
BLOSUM45
PAM30
PAM70
最短比对长度(aa)
?
30
线程数
1
4
8
16
过滤低复杂度区域
SEG / DUST 过滤器
软掩蔽重复序列
Soft mask repeats
显示比对详细信息
输出比对序列块
比对数据库
选择目标数据库(可多选)
全选
清除
任务标识(可选)
提交 BLAST 任务
正在运行…
0%
使用提示
blastn
适用于基因片段定位、引物验证、近缘物种同源搜索
blastp
蛋白功能同源验证,跨科比较推荐设 E-value ≤ 1e-10
blastx
用未注释 CDS 查已知蛋白,快速功能预测
单次查询序列建议
≤ 100 kb
,超长序列请先切割后批量提交
比对结果
程序
blastn
数据库
—
命中
—
条
耗时
—
清除结果
导出 TSV
#
命中序列
物种
一致性
比对长度
得分
E-value
操作